#nexus
begin data ;
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matrix
[ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
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Contig# 1 AAGATTAAGCCATGCATGT?CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC?TGCGAATGGCTCATTAGG]
Acanthobdella_peledina AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAGACTTTCACATAGTGAAAC-CGCAAATGGCTCATTAAA
Ankyrodrilus_legaeus AAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Bdellodrilus_illuminatus AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAGCACAGTGAACC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Branchiobdella_parasita AA??TTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAACTTTT-ACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Branchiobdella_pentodonta ???????????????????????????????????????????????????????????????????
Cambarincola_gracilis ?????TAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Cambarincola_holti AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Cambarincola_mesochoreus AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Cambarincola_montanus AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Cambarincola_pamelae AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Cambarincola_philadelphicus ???ATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAACCTGCGAATGGCTCATTAGG
Ceratodrilus_orphiorhysis AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Cirrodrilus_sapporensis AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Cronodrilus_ogygius AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Erpobdella_octoculata AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGCACATGCCTTCACATGGTAAAGC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Glossiphonia_complanata AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGCACAAACTTTAACACGGTGAACC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Hirudo_medicinalis AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGCTCATACCTTTACACGGTGAAGC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Lumbricus AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGCACAAACCTTTACACGGTGAAGC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Magmatodrilus_obscurus AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTATAAGCCTTTGTACTGTGAAAC-TGCGAATGGC?CATTAAA
Oedipodrilus_macbaini AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Piscicola_geometra AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGCACAAACTTTCAAACAGTGAAGC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Pterodrilus_annulatus AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Sathodrilus_attenuatus AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACGAACTTTAGCACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Triannulata_magna ???ATTAATGCCTGCATGTGCTAAGTACA?ACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Tubifex ???ATTAGCCCATGCATGT-CTAGGCACAA-CTTTA-CACAGT?AAGC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Xironidrilus_formosus AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACAAACTTTAACACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
Xironogiton_victoriensis AAGATTAAGCCATGCATGT-CTAAGTACGAACTTTAGCACAGTGAAAC-TGCGAATGGCTCATTAGG
[ 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210
| | | | | | | | | | |
Contig# 1 CCACCCAT?GATTTCTTAGATCGTACAATCCT?ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCCGACCTTT?ACGGGAA?GAGCGCGTT]
ACA_18S TCAGTTAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGAAACTCCGCTCCGACCT-C-GCGGGAA-GAGCGCTTT
ANLE CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATC?T-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTTAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
BDIL_18S CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTAAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
BRPA_18S CCACCCAT-GATTTATTAGATCGTACAATCCT-ACTGGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCAGACCGTT-AAGGGAA-GAGCGCGTT
BRPE ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CAGR_18s CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTTAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
CAHO_18s CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTTAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
CAME_18S CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTTAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
CAMO_18S CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTTAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
CAPA_18s CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
CAPH_18s CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTTAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
CEPR CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTTAAGCTCCGACCTTT-AAGGGAA-GAGCGCGTT
CISA_18s CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGACAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCCGACCTTT-TCGGGAA-GAGCGCGTT
CROG_18s CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
EOC_18S CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCTTACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATACAATCTCTGACCCGC-GAGGGAAAGAGAGCGTT
GC2_18S CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCAAAAAAGCTCGGACCCTC-GCGGGAACGAGCGCGTT
HIR_18S CCACCCAT-GATTTATTAGATCGTACTATTCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCAACCAAGCTCTGACCCGC-GAGGGGAGGAGCGCGTT
Lumb_rub18s CCACCCATCAATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCCACAAAGCTCCGCCCTT--ATGGGAAAGAGCGCGTT
MOBS TCAGTTAT-AGTTTATTTGATGGT-TTTTGCT-ACATGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCCCCGACTTC---TGGAAG-GGGTGTATT
OEMA_18s CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
PGEO_18S CCACCCAT-GATTTATTAGATCGTAAAAATTT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCACTAAAGCTCCGACCTT--ACGGAAA-GGGCGCGTT
PTAN_18S CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
SAAT_18S CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTATTATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCCGACCTTT--CGGGAA-GAGCGCGTT
TRMA_18s CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCCGACCTTT--CGGGAC-GAGCGCGTT
Tubifex_18s TCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCGAGCAAGCTCCGACCCCTCGTGGGAAAGAGCGCGTT
xifo CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTACAATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTTAAGCTCCGACCTTT-ACGGGAA-GAGCGCGTT
XIVI_18s CCACCCAT-GATTTCTTAGATCGTATTATCCT-ACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATTCAAGCTCCGACCTTT--CGGGAA-GAGCGCGTT
[ 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320
| | | | | | | | | | |
Contig# 1 TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC?????????????????C???????CGYCT?GTTGGTGACTCT?GGAT?AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCHCGTG]
ACA_18S TATTAGATCAAGATCAATCGGGTTTC--GGC-----------------C-------CGTCCTATTGGTGATTCT-GAAT-AACTTTGTGCTGATCGCACGGCCACGAG
ANLE TATTAGATCAAAACCAATCAGGTCTCACGAC-----------------C-------TGTGTAGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
BDIL_18S TATTAGATCAAAACCAATCGGGTTTCACGAC-----------------C-------CGCTTTGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCAGTG
BRPA_18S TATTAGATCAAAACCATCGGGAGCACATTAT--------GTGTGCGTAC-------CCTTCAGTTGGTGACTCTTGGAT-AACCTTAGAC-GATCGCATGGCCCTGTG
BRPE ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CAGR_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC-----------------C-------CGCCTTGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
CAHO_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC-----------------C-------CGCCTAATTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
CAME_18S TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC-----------------C-------CGCCTAATTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
CAMO_18S TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC-----------------C-------CGTCTTGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
CAPA_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC-----------------C-------CGCATAATTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
CAPH_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC-----------------C-------CGCCTAATTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
CEPR TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC-----------------C-------CGCCTTGTTGGTGACTCTTGGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
CISA_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC-----------------C-------CGTCATGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTTGAGCTGATCGCATGGCCTCGTG
CROG_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGAC-----------------C-------CGCCTAATTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
EOC_18S TATTAGATCAAAACTAATCGGATGTTACGGCTCCCGGTCTCGGCCGGGCGTCGGTCCGCATCGTTGGTGACTCT-GGAT-AACTTCGAGCTGATCGCACAGCCTTGAG
GC2_18S TATTAGATCAAAACCAATCGGATCGCAAGGT-----------------C-------CGTCCCGTTGGTGACTCT-GGAT-AACTTCGAGCAGATCGCACGGCCTCGCG
HIR_18S TATTAGATCAAAACCAATCGGTTCTT-CGTCTCT---TCGCGG--GGACGGAGG-CCGTAACGATGGTGACTCT-GGAT-AACTTCGGGCGGATCGCATGACCTCGAG
Lumb_rub18s TATTAGGTCAAA-CCAATCGGGTCCT-CG-C--------G-GCCCGTAA-------CTC-----TGATAACTCT-GGATTAACTTCGAGCTGATCGCATGGCCTCGCG
MOBS2 TATTAGATAAAAATCAA-----CTTT------------------------------------GTTGGTGAATCA-TAAT-AACTTC--TCGGACCGCATGGCCTTGTG
OEMA_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGGTTTCACGAC-----------------C-------CGTCTTGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
PGEO_18S TATTAGATCAAAATCAATCGGGCTTCG--------------GCTCGTAA--------ATT---TTGGTGACTCT-GAAT-AAATTACGGCTGATCGCACGACCTAGCG
PTAN_18S TATTAGATCAAAACCAATCGGGCCTCACGGC-----------------C-------CGTCTTGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
SAAT_18S TATTAGATCAAAACCAATCGGGTTTCACGAC-----------------C-------CGCC-TGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTTGAGCTGATCGCATGGCCTCGGG
TRMA_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGGTCTCACGGC-----------------C-------CGTCATGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCTCGTG
Tubifex_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGG-CTCTCGG-----------GTCCGTAC--------GT----TTGGTGACTCT-GGAT-AACTTTGAGCGGATCGCACGGGCTTGTC
xifo TATTAGATCAAAACCAATCAGGTCTCACGAC-----------------C-------TGTGTAGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTCGAGCTGATCGCATGGCCCCGTG
XIVI_18s TATTAGATCAAAACCAATCGGGTTTCACGAC-----------------C-------CGCC-TGTTGGTGACTCT-GGAT-AACCTTGAGCTGATCGCATGGCCTCGGG
[ 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420
| | | | | | | | | |
Contig# 1 CCGG?CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT?GACHTGCCTACCATGGTTGT?AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA]
ACA_18S CCGG-CGACGTATCTTTCAAGTGTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GATATGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGAGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
AnLE CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACTTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
BDIL_18S CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
BRPA_18S CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACTTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
BRPE ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CAGR_18s CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACTTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
CAHO_18s CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
CAME_18S CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
CAMO_18S CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACTTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
CAPA_18s CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
CAPH_18s CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
CEPR CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
CISA_18s CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
CROG_18s CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
EOC_18S CTGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACTTGCCTACCATGGTCAT-AACGGGTAACGGAGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
GC2_18S CCGG-CGACGGGTCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGC-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
HIR_18S TCGG-CGACAGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGC-GACTTGCCTACCATGGTAGT-AACGGGTTACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
Lumb_rub18s CCGGGCGACGTATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGTAGATATGCCTACCATGGTAGTTAACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
MOBS CTGG-CGGTGCTTCATTCAAATATCTGCCCTATCAACTGTCGATGGTAGGA-TAGAGGCCTACCATGGTTGC-AACGGGTAACGGGGAATAAGGGTTCGATTCCGGA
OEMA_18s CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACTTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
PGEO_18S TCGG-CGACAGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTATGT-GATATGCTTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
PTAN_18S CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACTTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
SAAT_18S CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
TRMA_18s CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
Tubifex_18s CCGG-CGACGTATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGC-GATATGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
xifo CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACTTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
XIVI_18s CCGG-CGACGGATCTTTCAAGTGTGTGCCCTATCAACTTTCGATGGTACGT-GACCTGCCTACCATGGTTGT-AACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGA
[ 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530
| | | | | | | | | | |
Contig# 1 GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA?GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC]
ACA_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATTCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTTGCACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGATCT
ANLE GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACACAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
BDIL_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACACAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
BRPA_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACACAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
BRPE ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CAGR_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
CAHO_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
CAME_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
CAMO_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
CAPA_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
CAPH_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
CEPR GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
CISA_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACACAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
CROG_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
EOC_18S GAGGGAGCATGAGATACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCATTCCTAATTCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
GC2_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACGATACGGGACTC
HIR_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATGCAAGGAAGGCAAGCAGGCGCGCAAATCACCCACTCCTAACTCACTTAGGTAGTTACGAAAAATATCGATTCGGGACTC
Lumb_rub18s GAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACAGGGCCT
MOBS GAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATATGTCACAATATACGGCCT
OEMA_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
PGEO_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCATTCCTAACACAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGAGTCTC
PTAN_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
SAAT_18S GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
TRMA_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACAT?CAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACACAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
Tubifex_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGACACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
xifo GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACACAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
XIVI_18s GAGGGAGCATGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCA-GCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCTAACGCAGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACTC
[ 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640
| | | | | | | | | | |
Contig# 1 THAT??GAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT?GGTGCCAGCA?GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT]
ACA_18S CTTC--GAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCTATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTTCAAT
ANLE TAAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
BDIL_18S TATT--GAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
BRPA_18S TTTT--GAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
BRPE ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CAGR_18s TCAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
CAHO_18s TCAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
CAME_18S TCAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
CAMO_18S TCAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
CAPA_18s TCAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
CAPH_18s TCAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
CEPR TCAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
CISA_18s TTTT--GAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
CROG_18s TCAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
EOC_18S TTAC--GAGGCCCCGTGATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
GC2_18S TAAT--GAGGCCCCGTAATCGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
HIR_18S TCAT--GAGGCCGCGTGATCGGAATGAGTTCACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTTGGTGCCAGAA-GCCGCGGTCATGCCAGCTTCAAT
Lumb_rub18s CTTTTCGAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTCCACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCTATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
MOBS -TAT---ACGTCGTATAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
OEMA_18s TCAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
PGEO_18S TTAT--GAGGCCTCGTAATTGGAATGAGTAGAATTTAAATCCTTTAATGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
PTAN_18S TCTT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
SAAT_18S AATT--GAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
TRMA_18s TTTT--GAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
Tubifex_18s ATTC--GAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
XIFO TAAT--GAGGCTCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
XIVI_18s AATT--GAGGCCCCGTAATTGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCT-GGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAT
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| | | | | | | | | |
Contig# 1 AGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTA?GTTGGATCTCTGGTCCAGGCTCGCGGTTCGCCTCGCGGCGAC?ACTGCCCG?TCCTGACCTACCAACCG]
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BRPE ???CTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTA-GTTGGATCTCTGGTTTAGGCTCGCGGTTCGCCTCGCGGCGAT-ACTGCCCG-TCCTGACCTACCAACCG
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| | | | | | | | | | |
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Tubifex_18s ?TTTT-CCCTTGGTGCTCTTCGCTGAGTGCTTTGGGTGGCCGGAACGTTTACTTTAAAAAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGC-GGACT-GCCTGAATAATAGTGCAT
XIFO GTTTT-CCCTTGGTGCTCTTCACTGAGTGCTTCGGGTGGCCGGATCGTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGC-ATCTC-GCCTGTATAGTGGTGCAT
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[ 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960
| | | | | | | | | | |
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CISA_18s GGAATAATAGAATAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTCGGGACTCGA?GTAATGATTAACAGGGACAGACGGGGGCATTCGTATTACGGTGTTAGAGGTGAAA
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[ 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070
| | | | | | | | | | |
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BRPE TTCTTGGATCGCCGTAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTCAGAGGTTCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAG
CAGR_18s TTCTTGGATCGCCGTAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTCAGAGGTTCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAG
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[ 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170
| | | | | | | | | |
Contig# 1 TTCTGACCATAAACGATGTCAACTAGCGATCCGC?GGGAGTTGTT??TTCATGACCCCGCGGGCAGCCTCCGGGAAACCAAAGTTTTTGGATTCCGGGGGAAGTATG]
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Lumb_rub18s TTCTGACCATAAACGATGTCGACTGGCGATCCGC-GGGCGTTGCT--TCTATGACCCCGCGGGCAGCCTTCGGGAAACCAAAGTTTTTGGATTCCGGGGGGAGTATG
MOBS TTcTgACcaTAAACTATGtCGACTAGcGATCcGc-gGgaGTTGTC--TTcATGACcCCgCgGGCACCTTCCGGGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATG
OEMA_18s TTCTGACCATAAACGATGTCAACTAGCGATCCGC-GGGAGTTGTT--TTCATGACCCCGCGGGCAGCCTCCGGGAAACCAAAGTTTTTGGATTCCGGGGGAAGTATG
PGEO_18S TTCTGACCATAAACGATGTCGTCTGACGATCCGT-GGGAGTTGTT--CGTATGACCCCGCGGGCAGTCTCCGGGAAACCAAAGATTTTGGATTCCGGGGGAAGTATG
PTAN_18S TTCTGACCATAAACGATGTCAACTAGCGATCCGC-GGGAGTTGTT--TTCATGACCCCGCGGGCAGCCTCCGGGAAACCAAAGTTTTTGGATTCCGGGGGAAGTATG
SAAT_18S TTCTGACCATAAACGATGTCAACTAGCGATCCGC-GGGAGTTGTT--TTCATGACCCCGCGGGCAGCCTTCGGGAAACCAAAGTTTTTGGATTCCGGGGGAAGTATG
TRMA_18s TTCTGACCATAAACGATGTCAACTAGCGATCCGC-GGGAGTTGTT--TTCATGACCCCGCGGGCAGCCTCCGGGAAACCAAAGTTTTTGGATTCCGGGGGAAGTATG
Tubifex_18s TTCTGACCATAAACGATGCCAACTGGCGATCCGC-GGGCGTTGAT--CTAATGACCCCGCGGGCAGCCTCCGGGAAACCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGAAGTATG
XIFO TTCTGACCATAAACGATGTCAACTAGCGATCCGC-GGGAGTTGTA--TTAATGACCCCGCGGGCAGCCTCCGGGAAACCAAAGTTTTTGGATTCCGGGGGAAGTATG
XIVI_18s TTCTGACCATAAACGATGTCAACTAGCGATCCGC-GGGAGTTGTT--TTCATGACCCCGCGGGCAGCCTTCGGGAAACCAAAGTTTTTGGATTCCGGGGGAAGTATG
[ 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280
| | | | | | | | | | |
Contig# 1 GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC]
ACA_18S GTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCCCCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGT
ANLE GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
BDIL_18S GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGC?CCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
BRPA_18S GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACTCGGCCCGGACACTGC
BRPE GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
CAGR_18s GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
CAHO_18s GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
CAME_18S GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
CAMO_18S GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
CAPA_18s GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
CAPH_18s GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
CEPR GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
CISA_18s GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGG?CCGGACACTGC
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Lumb_rub18s GTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
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PGEO_18S GTTGCAAAGCCGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGT
PTAN_18S GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
SAAT_18S GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
TRMA_18s GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGA?CCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
Tubifex_18s GTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACCGT
XIFO GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
XIVI_18s GTTGCAAAACAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCCGGCCCGGACACTGC
[ 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390
| | | | | | | | | | |
Contig# 1 AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC]
ACA_18S AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
ANLE AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
BDIL_18S AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
BRPA_18S AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
BRPE AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGG-CGTTCTT??????????????????????????????????????????????
CAGR_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
CAHO_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
CAME_18S AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
CAMO_18S AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
CAPA_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
CAPH_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
CEPR AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCSTTCTT??????????????????????????????????????????????
CISA_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
CROG_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
EOC_18S TAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
GC2_18S GAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
HIR_18S AAGGATTGACAGATTGATAGCTCTTTCTTAATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
Lumb_rub18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
MOBS AAGGATTGACAGATTGATAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTTTTAGTTGGT?GAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
OEMA_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
PGEO_18S AAGGATTGACAGATTGATAGCTCTTTCTTGATTCAGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTCGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
PTAN_18S AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
SAAT_18S AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
TRMA_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
Tubifex_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
XIFO AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
XIVI_18s AAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGAC
[ 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490
| | | | | | | | | |
Contig# 1 TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG???????CAAC???????????????????????????????????CTGTCGGTGC?AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG]
ACA_18S TCTAGCCTATTAACTAGT----TCGTCGATCC-------TCAT-----------------------------------GCGTCGACGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
ANLE TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
BDIL_18S TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGTCGATAG-------CAAT-----------------------------------CTGTCGGCGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
BRPA_18S TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCTGATAG-------CAAC-----------------------------------CTATCGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
BRPE ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CAGR_18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
CAHO_18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
CAME_18S TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
CAMO_18S TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
CAPA_18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAT-----------------------------------CTGTCGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
CAPH_18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
CEPR ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CISA_18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGTCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGCGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
CROG_18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTTGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
EOC_18S TCTAGCCTGCTAAATAGT----CCG?CGGTTG-------T-AC-------------TTCAAA--TCTGAA-------GCTACCGACGCTGACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
GC2_18S TCTAGCCTGCTAAATAGT----CCGCCGATCG-------TCTT-----------------------------------GCGTCGGCGCCGACTTCTTAGAGGGACAAGCGG
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Lumb_rub18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGTCGATGG-------CACT-----------------------------------CTGTCGGCGCTAACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
MOBS CTTAACCTGCTAAATAGC---CCCATCGACTA-------TGG------------------------------------TTGGTGGCTG--GCTTCTTAGAGGGACTATTGG
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PGEO_18S TCTAACCTACTAAATAGT----CAACCGATTA-------AATT-----------------------------------CTGTCGGTGCCGACTTCTTAGGGGGACAAGCGA
PTAN_18S TCTAGCCTGCTAAATAGT----TAGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGTGA-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
SAAT_18S TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAT-----------------------------------CTGTCGGCGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
TRMA_18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGTGC-AACTTCTTAGAGGG?CAAGTGG
Tubifex_18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCACCGATT--------CACC-----------------------------------GAGTCGGTGTTAACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
XIFO TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAC-----------------------------------CTGTCGGTGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
XIVI_18s TCTAGCCTGCTAAATAGT----TCGCCGATAG-------CAAT-----------------------------------CTGTCGGCGC-AACTTCTTAGAGGGACAAGTGG
[ 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600
| | | | | | | | | | |
Contig# 1 CGTTTAGTCAC?ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT?TT?CTCCTGAT]
ACA_18S CGTTTAGCCAC-ACGAAATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-CTAC-CCTGGC
ANLE CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
BDIL_18S CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-TTCCTGAT
BRPA_18S CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAACGTGTGT-TT-CTCCTGAT
BRPE ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CAGR_18s CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
CAHO_18s CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
CAME_18S CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
CAMO_18S CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
CAPA_18s CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
CAPH_18s CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
CEPR ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CISA_18s CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCACCGTGTGT-TT-CTCCTGTT
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EOC_18S CGCTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGCTTATT-TTCCTGTT
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HIR_18S CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTTTTTCGTTCCTGCT
Lumb_rub18s CGTTTAGTCACCACGAGATTGAG-CAATAACAGGTC-GTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAGTCAACGTGTCT-GC-TTCCTGAT
MOBS CTTCCAGCCAATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACGGAGCCAACGAGTAC-TT-TCCTTG-T
OEMA_18s CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
PGEO_18S CTTATAGTCGC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTTT-TCAC-CCTGTT
PTAN_18S CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
SAAT_18S CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
TRMA_18s CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
Tubifex_18s CGTTTAGCCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TC-TCCCTGAT
XIFO CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
XIVI_18s CGTTTAGTCAC-ACGAGATTGAG-CAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTGT-TT-CTCCTGAT
[ 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710
| | | | | | | | | | |
Contig# 1 CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC]
ACA_18S CCGGAAGGGTCGGGGAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
ANLE CCGCAAGGACTGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
BDIL_18S CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
BRPA_18S CCGCAAGGACCGGGTAACCCGCTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
BRPE ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CAGR_18s CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
CAHO_18s CCGCAAGGACTGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
CAME_18S CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
CAMO_18S CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
CAPA_18s CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
CAPH_18s CCGCAAGGACTGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
CEPR ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CISA_18s CCGCAAGGACTGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
CROG_18s CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
EOC_18S CCGCGAGGAACGGGTAACCCGCTGAAACTCCTTCGTGCTAGGGATCGGGGCTTGTAATTTTTCCCCGTGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCACTAACTCGC
GC2_18S CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATCGGGGCTTGTAATTCTTCCCCGTGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
HIR_18S CCGCGAGGAGTGGGTAACCCGTTGAAACTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGTTTGTAATTTTCCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
Lumb_rub18s CCGAAAGGACCGGGTAACCCGATGAACTTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTCTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
MOBS CCGGAAGGACTGGGTAATCTTGTGAAACTTCGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGTGAGTCATCAGCTCGC
OEMA_18s CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
PGEO_18S TCGAGAGATTCGGGTAATCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTATTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAACTCGC
PTAN_18S CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGCAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
SAAT_18S CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
TRMA_18s CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
Tubifex_18s CCGTAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGTGGCTTGCAATTATTCCACATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTTATAAGCTCGC
XIFO CCGCAAGGACTGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
XIVI_18s CCGCAAGGACCGGGTAACCCGTTGAACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGTAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGC
[ 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810
| | | | | | | | | |
Contig# 1 GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG?GG--CCCGGCCTGGG?GGAAA-CT?TCGGGT]
ACA_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATTG-GT--CCCGGCATGGGGGGAAA-CTCCCGGGC
ANLE GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGAAGGAAA-CTTTCGGGT
BDIL_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATTG-GG--CCCGGCCTAGAGGGAAA-CCTTCGGGT
BRPA_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-----TCCTGACTGATATAATTAATTATCGGT
BRPE ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CAGR_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-G---CCCGGCCTGGAAGGAAA-CTTTCGGGT
CAHO_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGGAGGAAA-CTCTTGGGT
CAME_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGGAGGAAA-CTCTTGGGT
CAMO_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGGAGGAAA-CTTTCGGGT
CAPA_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGGAGGAAA-CTTTCGGGT
CAPH_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGGCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGGAGGAAA-CTCTTGGGT
CEPR ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CISA_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATTG-GG--CCCGGTCTTGAGGGAAA-CCTTCGGGT
CROG_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGGAGGAAA-CTCTCGGGT
EOC_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGACCGTCGCTACTACCGATCGGATGTTTTAGTGAGGTCTTTGGATCGCGC--CCTCTGCCGCGGTTTTA-GTCTCGGCT
GC2_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGGTCCTCGGATTG-GA--CCCGTCGCGCGGGGCGA-CTCGCGCGG
HIR_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGGTCATCGGATCG--AAGGCTCGGCGGGGCTTCAC-GGCCTTGCC
Lumb_rub18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGGTCCTCGGATTG-GA--CCCGCC--GAAGGGCAA-CT-TCGGGT
MOBS GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGCTTAGTGAGCCTTTGGGATTG-GCAGCTTGTACCGGC----AA-C---GGTAG
OEMA_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGGAGGAAA-CTTTCGGGT
PGEO_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGGTCCTCAGATTG-GG--CCCGTATTGAAGAGCAA-TCTTCGATG
PTAN_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGGAGGAAA-CTTTCGGGT
SAAT_18S GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATTG-GG--CCCGGTCTGGTGGGCAA-CCATCGGGT
TRMA_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGTTGGGAAA-CCTTCGGGT
Tubifex_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATTG-GA--CCCGGCGCGGCGGGCAA-CCGTCGTGC
XIFO GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCG-GG--CCCGGCCTGGAAGGAAA-CTTTCGGGT
XIVI_18s GTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATTG-GG--CCCGGTCTGGTGGGCAA-CCATCGGGT
[ 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910
| | | | | | | | | |
Contig# 1 C?GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA]
ACA_18S C-GGTGCGCCGAGAAGTTGCTCGAACTTGATCATTTAGA
ANLE C-GGAGTCCTGTAAAGACGATCCAACTTGATCATCTAGA
BDIL_18S C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
BRPA_18S CAAGCTGCTCGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
BRPE ???????????????????????????????????????
CAGR_18s C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
CAHO_18s C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
CAME_18S C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
CAMO_18S C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
CAPA_18s C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
CAPH_18s C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
CEPR ???????????????????????????????????????
CISA_18s C-GGAGTCCCGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
CROG_18s C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
EOC_18S CCGGTTGCGCGAAAAGAAAATCGAACTTGATCATCTA?A
GC2_18S C-GACGTTCCGAGAAGACGATCGAACTTGATCATCTAGA
HIR_18S GCGATTCTTTGAGAAGACGATCGAACTTGATCATCTAGA
Lumb_rub18s C-GGTGATCCGAAAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
MOBS C-AGGCCGCTGAAAACTTAGGCAAACTTGGTCATTTAGA
OEMA_18s C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
PGEO_18S CGGATGTCC-GAGAAGACGATCGAACTTGATCATCTAGA
PTAN_18S C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
SAAT_18S CCGGAGTCCCGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
TRMA_18s C-GGAGTCCTGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
Tubifex_18s C-GGTGTTCCGAAAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
XIFO C-GGAGTCCTGAAAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
XIVI_18s C-GGAGTCCCGAGAAGACGATCAAACTTGATCATCTAGA
[ 10 20 30 40 50 60 70 80 90
| | | | | | | | |
Contig# GCTTGATCAGC?ATAGTAGGAACHGCTATAAGAGT?ATTATTCGAATAGAATTAGCTCAACCAGGA]
ACA_COI GCATGAGCTGGGATCCTAGGCACAGCTCTAAGCCTCCTTATTCGAGCCGAGCTGGGCCAGCCAGGC
ANLE AGTGgaTcAgCTATAGTAGGAACATcaATAAGAGTAATTATTCGAATAGAGCTTGCTCAACCAGGA
BDIL_COI GCTTGATCATGCATAGTAGGAACTGCTATAAGAGTAATTATTCGAATAGAATTAGCACAACCAGGA
BRPA_COI GCATGATCAGCATTACTAGGAACTGCTATAAGAGTAATTATTCGAATAGAGTTAGCCCAACCAGGG
BRPE GCCTGATCTGCTATACTAGGAACTTCTATAAGAGTTATTATTCGAATAGAACTAGCTCAACCTGGT
CAGR_COI ?????????????????????????CACTAAGAATTATTATTCGGATAGAGCTTGCTCAACCTGGA
caho GCCTGGTCTGCCATGGTAGGCACCTCTATGAGAGTAATCATTCGTATAGAGTTAGCCCAACCAGGA
CAME_COI GCTTGATCAGCTATAGT?GGCACATCTATAAGGGTTATTATCCGAATAGAACTGGCACAACCAGGG
CAMO_COI GCTTGATCAGCCATAGTAGGAACTTCTATAAGAGTGATTATTCGAATAGAGCTTGCTCAACCAGGA
CAPA_COI GCTTGATCAGCTATAGTTGGAACTTCAATAAGAGTAATTATTCGAATAGAATTAGCTCAACCAGGA
CAPH_COI GCCTGGTCTGCCATGGTAGGCACCTCTATAAGAGTAATCATTCGTATAGAGTTAGCCCAACCAGGA
CEPR ???AGCaTGCaTAtAGTaGGAACCGCTATAAGAGTTATTATTCGTATCGAatTAGCTCAACCAGGa
CISA_lcO ????????????ATGGTAGGAACAGCTATAAGGGTAATTATTCGAATAGAACTAGC?CAACCAGGA
CROG_COI GCCTGATCAGCTATAGTAGGAACTTCAATAAGAGTAATTATTCGTATAGAATTAGCTCAACCAGGA
EOC_COI ACATGATCAGCCATAGCTGGTACAGGTATAAGGGTATTAATTCGAATTGAATTAGCACAACCTGGT
GC2_co1 GCTTGAGCTGCCATAGTAGGAACTGCAATAAGAATTATTATTCGAATTGAGTTAGCTCAACCAGGA
HIR_COI GCTTGAGCTGCTATATTAGGATCCTCTATAAGTACTATTATTCGGATTGAATTATCTCAGCCAGGT
LUMBRICU GTATGGGCTGGCATGGTGGGAGCCGGAATAAGACTTCTTATCCGTATTGAGCTAAGACAACCTGGT
MOBS ??????????????????????????????????????????????TCAACATATCATAACCAGAT
OEMA_COI GCGTGATCAGCAATAGTTGGAACTTCTATAAGAGTTATCATTCGAATAGAGCTTGCTCAACCAGGA
PGEO_co1 GCTTGAGCAGCAATATTAGGAACTTCAATAAGATTTATTATTCGATCTGAATTATCACAACCAGGT
PTAN_COI GCCTGATCAGCAATAGTAGGAACCTCTATAAGAGTAATTATTCGAATAGAGTTAGCTCAACCTGGA
SAAT_COI GCTTGATCAGGTATAGTAGGAACTGCTATAAGAATTATCATTCGAATAGAACTAGCTCAACCTGGT
TRMA_COI GCATGATCAGCTATAGTTGGAACAGCTATAAGAGTTATAATGCGGATAGAATTAGCTCAACCTGGA
Tubifex ATTTGAGCAGGTATAGTTGGCACCGGAACAAGTCTACTGATTCGTCTAGAACTAGCTCAACCTGGC
XIFO2_co CATGCATATAAGATAGTTGCGGCAACAAATCATAATAGATACGGGTGCGACTTAGCACAACCGGGG
XIVI_COI GCTTGATCAGGCATAGTAGGAACCGCTATAAGAATTATTATTCGAATAGAGTTAGCTCAACCTGGA
[ 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190
| | | | | | | | | |
Contig# TCATT?CTHVAAAATVG?CAA?TATATAACTCHTTAATTAC?GCTCATGGATTAATTATAATTTTTTTTATAGTAATACCTATTTTAATTGGAGG?]
ACA_COI AACCTTCTAGGTAACGACCACATCTACAACGTTATCGTCACAGCCCATGCATTTGTAATAATCTTCTTCATAGTAATACCCATCATAATCGGAGGC
ANLE TCTATACTTCAAAATAGACAAGTATATAATTCTTTAATTACTGCTCATGG?TTAATTATAATTTTCTTTGTAGTAATGCCTATTTTAATTGGTGGA
BDIL_COI TCATTACTTAATGACAGTCACCTATATAATACATTAATTACTGCTCATGGATTAATTATAATTTTTTTTATGTTAATGCCTATTTTAATTGGTGGT
BRPA_COI TCTTTGCTTAACAATCGGCAGCTATATCACTTATTAATTACAGCACATGGATTAGTTATAATTTTTCTTATTGGAATGCCTATTTTAATTGGAGGG
BRPE TCTTTATTAAATAATAGCCAACTATATAACTCACTAATCACTGCTCATGGATTAGTTATAATTTTCTTTATAGTAATACCTATTTTAATTGGGGGT
CAGR_COI TCCTTACTTCAAGACAGCCAACTTTATAATTCTATAATTACCGCTCACGGATTAATTATAATTTTTTTCATGGTAATACCTATTTTAATTGGAGGT
caho TCTTTATTACAAGATAGGCAACTATATAACTCCTTAATTACTGCTCACGGTTTAATTATAATTTTTTTTATAGTAATACCAATTTTAATCGGGGGT
CAME_COI TCATTACTTCAAGACAGGCAACTATATAACTCTTTAATTACCGCACATGGGTTAATTATAATTTTTTTTATAGTAATACCTATTCTAATTGGTGGT
CAMO_COI TCCTTGCTTCAAGATAGACAACTATACAACTCTCTAATTACTGCACATGGGTTAATTATAATTTTTTTTATAGTTATGCCTATTTTAATTGGAGGG
CAPA_COI TCATTATTAAATGATAGACAATTATATAATTCATTAATTACTGCTCATGGATTAATTATAATTTTTTTTATAGTAATGCCCATCTTAATTGGAGGT
CAPH_COI TCTTTATTACAAGATAGGCAACTATATAACTCCTTAATTACTGCTCACGGTTTAATTATAATTTTTTTTATAGTAATACCAATTTTAATCGGGGGT
CEPR TCATTatTAaATaACaatCAATTATATAACTGCATAATTACtGCTCAtGGATTAATtATAATTTTTTTaATrGTAtTaCCtATTTAAATTGGaGGT
CISA_lcO TCTATGCTAAATAAT??ACAACTATATAACTGTATAATTAC?GCTCATGGATTA?TCATAATTTTTTTTATAGTAATACCTATTCTAATTGGAGGA
CROG_COI TCTTTACTTAATGATAGTCAATTGTATAATTCATTAATTACTGCTCATGGGTTAATTATAATTTTTTTTATAGTAATACCTATTTTAATTGGGGGG
EOC_COI ACATTCCTAGGGAACGACCAAATTTATAACACTATTGTAACCGCTCATGGGTTAGTAATAATTTTTTTTATAGTAATACCTATTTTAATTGGAGGT
GC2_co1 TCATTTTTAAATAATGATCAACTATATAATTGTATTATTACTGCTCACGGATTAATTATAATTTTCTTCATAGTTATACCAATTTTAATTGGTGGA
HIR_COI AGTTTTCTTGGTGATGATCAACTTTATAATTCCTTGATTACTGCACATGGACTTATTATAATTTTTTTTATGGTAATACCTATTTTGAATTGAGGT
LUMBRICU GCATTCCTAGGAAGTGACCAATTATACAATACAATCGTTACTGCGCAC???TTTGTTATAATTTTCTTCCTAGTGATACCAGTCTTCATTGGCGGG
MOBS TGGTCATCAGAACATGATCATATATATAACTGTATAATTACAGCTCATGGATTAATTATAATTGTTTTCATAGTTATACCTATCTTAATTGGTGGA
OEMA_COI TCACTACTTCAAGATAGGCAATTATATAATTCATTAATCACGGCTCATGGATTAATCATAATTTTCTTCATAGTAATACCTATTTTAATTGGAGGT
PGEO_co1 AGATTAATTGAAAATGATCAAATTTATAATTCTATAATTACAGCTCATGGTTTAATTATAATTTTTTTTATAGTAATACCTATTTTAATTGGTGGT
PTAN_COI TCCTTATTAGCAGATAGACAAGTATATAACTCATTAATTACTGCCCATGGGTTAATTATAATTTTCTTCATAGTAATACCAATTTTAATTGGGGGT
SAAT_COI TCACTTCTTCAAAACAGACAACTATATAATTCATTAATTACAGCTCACGGCTTAATTATAATTTTTTTTATAGTTATACCTATCTTAATTGGAGGA
TRMA_COI TCATTATTAAATAACGGCCAGTTATATAACTCATTAATTACAGCACATGGATTAATTATAATTTTTTTTGTAGTAATACCTATTTTAATTGGAGGA
Tubifex TCTTTCCTCGGCAGCGACCAATTATATAACACATTAGTTACAGCACATGCATTCCTTATAATCTTCTTTATGGTAATACCTATTTACATTGGGGGA
XIFO2_co TCATTTTTAGAAAATGATCAGATATATAACTGTATAATTACAGCTCATGGATTAATTATAATTCTTTTCATAGTTATACCTATCTTAATTGGAGGA
XIVI_COI TCACTTCTTCAAAACAGGCAACTATACAACTCCTTAATTACAGCTCATGGATTAATTATAATTTTTTTTATAGTAATACCTATCTTAATTGGAGGT
[ 200 210 220 230 240 250 260 270 280
| | | | | | | | |
Contig# TTTGGAAATTGATTA?T?CCATTAATAHTAGG??CACCHGATATAGC?TTCCC?CGATTAAATAATTTAAGATTTTGACT?TTACCHBC?TCTATT]
ACA_COI TTTGGCAACTGACTAATTCCCCTAATAATCGGTGCCCCCGATATGGCGTTTCCCCGCATAAACAACATAAGCTTCTGACACTTACCTCCCTCTCTC
ANLE TTTGGAAACTGACTTTTACCTCTTATACTAGGAACACCTGATATAGCTTT?CCACGATTAAATAATTTAAGATTTTGATTACTACCATCATCAATC
BDIL_COI TTTGGAAACTGATTATTACCATTAATATTAGGTTCACCTGATATAGCATTCCCACGATTAAATAATTTAAGATTTTGACTATTACCTGCATCAATC
BRPA_COI TTTGGAAACTGGCTTCTTCCTTTAATATTAGGAAGACCTGACATAGAATTCCTTCAATTAAATAATTTAAGATTTTGATTACTACCATCCTCAATT
BRPE TTTGGAAATTGACTATTACCATTAATACTAGGGAGACCCGACATAGCTTTCCCACGATTAAATAACTTAAGATTTTGATTACTACCATCATCTATT
CAGR_COI TTTGGTAATTGATTACTCCCGCTAATATTAGGGGCACCAGACATAGCATTCCCACGTTTAAATAATTTAAGCTTTTGACTCCTTCCTGCTTCTATT
caho TTTGGTAACTGATTACTGCCTTTAATATTAGGGGCCCCTGATATAGCCTTCCCTCGACTTAATAATTTAAGATTTTGACTTCTTCCAGCCTCTATT
CAME_COI TTTGGTAATTGATTACTTCCATTAATACTAGGTACCCCCGATATAGCCTTCCCCCGATTAAATAATTTAAGCTTCTGACTATTGCCAGCTTCAATT
CAMO_COI TTTGGAAATTGACTTCTACCATTAATACTAGGGTCCCCAGATATAGCATTCCCTCGACTAAATAATTTAAGATTTTGGCTTTTACCTGCTTCTATT
CAPA_COI TTTGGAAATTGATTATTACCGCTAATATTAGGAACACCTGATATAGCTTTCCCACGATTAAACAATTTAAGATTTTGATTACTTCCAGCATCTATT
CAPH_COI TTTGGTAACTGATTACTGCCTTTAATATTAGGGGCCCCTGATATAGCCTTCCCTCGACTTAATAATTTAAGATTTTGACTTCTTCCAGCCTCTATT
CEPR TTtGGAAtTtGATTaaTtCCaTtAaTATTaGGaGCgcCaGACtTaGcATttC????????????????????????????????????????????
CISA_lcO TTTGGAAATTGACTGCTACCATTAATATTAGGAGCACCCGACATAGCATTTCCTCGATTAAATAATTTAAGATTCTGATTATTACCATCATCTATA
CROG_COI TTTGGAAATTGACTTTTACCACTTATATTAGGAACCCCTGATATAGCTTTCCCTCGATTAAATAACTTAAGATTTTGACTACTTCCAGCTTCTATT
EOC_COI TTTGGAAATTGGTTAATTCCATTAATAATTGGTGCCCCAGATATAGCCTTTCCTCGACTTAATAATCTAAGATTTTGACTGTTACCTCCGTCAATA
GC2_co1 TTTGGAAATTGATTAATTCCTTTAATATTAGGAGCACCAGATATAGCATTTCCACGATTAAATAATCTAAGGTTTTGACTATTACCTCCATCAATA
HIR_COI TTTGGAAATTGACTTTTACCATTAATAATTGGTCGCCATGATATAGCCTTTCCTCGTCTTAATATTTTAAGGTTTTGATTACTTCCACCATCATTC
LUMBRICU TTTGGGAACTGACTTCTTCCCCTAATACTGGGCGCTCCTGATATAGCATTCCCACGCCTTAATAACATAAGATTTTGACTTCTACCCCCCTCTCTT
MOBS TTTGGTAATTGATTAATTCCATTAATAATTGGAGCACCAGACATAGCATTTCCCCGATTAAATAATCTAGGGTTCTGACTGTTACCACCATCTATA
OEMA_COI TTTGGAAACTGACTTCTCCCATTAATACTAGGAACTCCAGATATAGCTTTTCCTCGATTAAATAACTTGAGATTTTGACTTTTACCAGCATCTATT
PGEO_co1 TTTGGAAATTGATTAATCCCATTAATAATTGGTGCCCCAGATATAGCCTTTCCTCGACTTAATAATTTAAGATTTTGATTATTACCACCATCTTTA
PTAN_COI TTTGGTAATTGATTGTTACCTTTAATATTAGGGACACCTGACATGGCTTTCCCTCGATTAAATAACTTAAGGTTTTGACTCCTCCCTGCGTCAATT
SAAT_COI TTTGGAAATTGATTGCTACCTTTAATACTAGGAACACCAGATATAGCTTTCCCTCGATTAAATAATTTAAGCTTTTGATTATTACCTTCCTCAATT
TRMA_COI TTTGGTAATTGACTATTACCATTAATATTAGGGTCACCAGATATAGCATTCCC?CGATTAAATAATTTAAGATTTTGACTT?TACCTTCATCACTT
Tubifex TTCGGAAATTGACTAGTCCCACTAATACTGGGGGCACCAGACATAGCATTCCCACGACTAAATAATCTTAGATTTTGACTTCTACCCCCCTCCCTA
XIFO2_co TTTGGTAATTGATTAATTCCATTAATAATTGGAGCACCAGACATAGCATTTCCCCGATTAAATAATCTTAGGTTTTGATTGTTACCACCATCTATA
XIVI_COI TTCGGAAACTGATTATTACCTTTAATATTAGGAACACCTGATATAGCTTTTCCCCGACTTAATAATTTAAGATTTTGATTATTACCCTCCTCAATT
[ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380
| | | | | | | | | |
Contig# ATT?TACTAGT?TCATCTGCTTTAGTDGAATC?GG?GT?GGAGCAGG?TGAACAGTATA?CC?CCATTATC?GC??TTCC?GCTCATGAA?GGACC]
ACA_COI CTACTCCTGCTCGCATCTGCTATTCTGGAAGCCGGAACAGGAACATGTGGAATAGTTTATCCTCTCTTAGGAGGGAATTACTCTCACCCTGTATC
ANLE TCTCTTCTAATTGCATCTGCATTAATTGAATCAGGAGTAGGTGGAGGATGAACAATCTACCCTCCTTTATCAGCAATTCCAGCTCACGT?GGACC
BDIL_COI ACTATACTTGTACTTTCAGCATTAACAGAATCAGGTGTAGGTGCAGGATGAACTATCTACCCTCCGTTGTCTTCTCTTCCATTTCATGAAGGCCC
BRPA_COI TTTATACTAACTTGTTCAGCTCTAGTGGAATCAGGAGTAGGAGGGGGTTGAACACTATACCCCCCATTATCCGCTTTACCAGCTCATGAAGGACC
BRPE ATCCTTTTAATCAGATCTGCTTTAATTGAATCTGGGGTAGGAGGAGGCTGAACTTTATACCCTCCTTTATCAGCTCTACCAGCCCATGAAGGACC
CAGR_COI ACCCT?CTAGCCTCCTCTGCTTTAATTGAATCAGGGGTTGGAGCCGGATGAACAGTATACCCCCCACTCTCAGCACTGCCCGCTCATGAAGGGCC
caho ACATTGCTAGCATCTTCTGCTTTAATTGAATCCGGCGTAGGAGCAGGGTGGACAGTATACCCACCCTTATCAGCTTTGCCGGCACATGAAGGTCC
CAME_COI ACTTTATTAGCCTCTTCTGCATTAATTGAATCCGGTGTTGGAGCAGGCTGAACCGTATACCCTCCATTATCCGCACTTCCTGCTCATGAAGGCCC
CAMO_COI ACTATGTTAGCATCTTCTGCATTAATTGAATCCGGAGTCGGAGCAGGGTGAACAGTATATCCCCCATTATCTGCACTACCTGCTCATGAAGGACC
CAPA_COI ACACTTCTAGCTTCATCTGCATTAATTGAATCTGGTGTTGGAGCAGGGTGAACTGTGTATCCTCCATTATCTGCATTACCTTATCATGAAGGACC
CAPH_COI ACATTGCTAGCATCTTCTGCTTTAATTGAATCCGGCGTAGGAGCAGGGTGGACAGTATACCCACCCTTATCAGCTTTGCCGGCACATGAAGGTCC
CEPR ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
CISA_lcO ATAGTATTAATATGCTCAGCTTTAGTAGAATCAGGAGTCGGAGCTGGTTGGACAG????????????????????????????????????????
CROG_COI ACTCTTTTAGCTTCATCAGCTTTAATTGAATCTGGAGTTGGAGCAGGCTGAACTGTATACCCTCCCCTTTCTGCTCTTCCTTCTCATGAAGGGCC
EOC_COI ATTATACTAGTTTTCTCTGCATTTGTAGAAAATGGTGTGGGGACTGGATGAACAGTATATCCTCCATTAGCATATAATATTGCCCATTCTGGACC
GC2_co1 ATTTTATTAGTTACTTCTGCCTTAGTAGAAAAAGGTGTAGGAACAGGATGAACAGTTTATCCTCCATTAGCTGCAAATTTAGCTCATTCTGGGCC
HIR_COI CAACTATATTGGCAAGTTCATGCAATAGGAAAAGGTGTTGGTACAGGATGAACTATAT??CCACCATTAGCGAAGTAGTAGTGCGCATTCGGACC
LUMBRICU ATTCTCCTAGTTTCCTCAGCTGCCGTAGAGAAGGGAGCCGGAACAGGCTGAACAGTGTACCCCCCTCTTGCCAGAAATCTCGCCCATGCTGGGCC
MOBS ATTTTATTAGTTACATGTGCTTTAGTAGAAAAAGGGGGTAGGACCAGGATGACAGTtTATCCACCTCTCGCTAGGAATATTGCTCACGCTGGACC
OEMA_COI ACACTACTAGCATCTTCAGCTTTAATTGAATCCGGTGTAGGAGCAGGGTGAACAGTATACCCCCCATTATCAGCCCTACCGGCTCACGAAGGACC
PGEO_co1 ATTATACTTTTAATATCTGCAATAGTAGAAAGTGGTGTAGGCACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCATCAAACATGGCTCACTCAGGTCC
PTAN_COI ACTTTACTAATTTCATCTGCATTAATTGAAACCGGGGTTGGTGCAGGGTGGACAATTTACCCACCATTATCTGCGCTACCTGCTCACGAAGGACC
SAAT_COI ATTTTACTAATCTCATCCGCATTAGTAGAATCAGGAGTAGGGAGAGGTTGAACTCTATATCCTCCATTAGCTAGACTTCCAGCTCATGAAGGGCC
TRMA_COI ATTATATTATCTTCATCTGCATTAGTTGAATCAGGAGTTGGAGCAGGGTGAACTGTATATCCTCCATTATCTGCCATTCCATATCATGAAGGGCC
Tubifex ATTCTACTTGTATCATCTGCTGCAGTGGAAAAAGGAGCTGGAACAGGGTGAACTGTCTACCCACCACTAGCCAGTAACTTAGCACACTCTGGACC
XIFO2_co ATTGTATTAGTTACATCTGCTTTAGTAGAAAAGGGGGTAGGAACAGGATGAACAGTTTATCCACCTCTCGCTAGGAATATTGCTCACGCTGGACC
XIVI_COI ATTTTATTAATTTCATCTGCTTTAGTGGAATCTGGGGTAGGAAGAGGTTGAACTTTATATCCACCATTAGCTAGACTTCCAGCTCATGAAGGACC
[ 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480
| | | | | | | | | |
Contig# ?TCTGT?GATTTAGCTATTTTTTC?TTACATTTAGCAGG?GCTTC?TCTATTTTAGG?GC?TTAAATTTTATAACTACTGT?ATAAATATACGATG]
ACA_COI CTCCGTAGACTTAGCTACTTCTTCCTTACACTTAGCAGGTGTTTCCGCTATTTTATCAGCCCTGAACTTTATAACTACAGTGATAAACATACGATG
ANLE ATCCGTGGAT?TAGCCATGTGTTTCATTCATTTATTTTTAGCTTCTTCAATTTTAGGCTCTTTAAACTTTATAACTACTGTAATAAATATACGTTG
BDIL_COI TTCTATTGATTTAGCAATTTTTTCTTTACACTTAGCAGGTGCTTCTTCTATTCTAGGTTCACTAAATTTTATAACTACAGTTATAAATATACGTAG
BRPA_COI ATCCGTAGACTTAGCAATTTTTTCATTACATCTAGCTGGTGCGTCTTCTATTTTAGGAGCCTTAAATTTCATAACTACTTTTATAAATATGCGGTG
BRPE TTCAGTTGATCTTGCTATTT-TTCTATTCATCTTGCTGGAGCCTCTTCAATTTTAGGGGCaTTAAACTTTATAACAACTTTTATAAATATGCGATG
CAGR_COI CTCTGTTGATTTAGCTATTTTCTCTTTACATTTAGCAGGAGCCTCCTCCATTTTAGGTGCCTTAAACTTTATAACTACCGTTATAAATATACGATG
caho ATCTGTTGATTTAGCTATCTTTTCCCTTCATCTTGCAGGAGCTTCATCTATTTTAGGAGCTTTAAATTTTATAACTACCGtCATAAATATGCGTTG
CAME_COI CTCAGTAGATTTAGCAATTTTCTCGCTACACTTGGCAGGAGCCTCTTCCATTCTAGGAGCTTTAAACTTTATAACAACTGTAATAAATATACGATG
CAMO_COI TTCTGTTGATTTAGCAATTTTTTCTTTACATTTAGCAGGGGCCTCTTCAATTTTAGGAGCCTTAAATTTTATAACAACAGTAATAAACATACGATG
CAPA_COI TTCTGTTGATTTAGCTATCTTTTCATTACACTTAGCAGGGGCTTCATCTATTTTAGGAGCTTTAAACTTTATAACCACTGTTATAAACATACGATG
CAPH_COI ATCTGTTGATTTAGCTATCTTTTCCCTTCATCTTGCAGGAGCTTCATCTATTTTAGGAGCTTTAAATTTTATAACTACCGTCATAAATATGCGTTG
CEPR ?????????????????tttTTCTATtaCATTTAGCaGGtGCTTCTTCTATTtTAGGaTCaTTAaAtTTtATAACaACaATTATTAAtATACGATG
CISA_lcO ????????????????????????????????????????????????????????????????AATTTTA?TA?TGCT?TTATTAATATACGATG
CROG_COI TTCTGTTGATTTAGCTATTTTTTCTTTACATTTAGCAGGGGCCTCCTCTATTTTAGGAGCATTAAATTTTATAACCACAATTATAAATATACGATG
EOC_COI ATCAGTAGATATAGCTATTTTCTCATTACACTTAGCAGGAGCTTCATCTATTTTAGGCTCATTAAATTTTATTTCTACTGTAGCAAATATACGATG
GC2_co1 ATCAGTAGATTTAGCTATTTTTTCTTTACATTTAGCAGGTGCTTCATCTATTCTAGGCTCATTAAATTTTATTACTACTATTATTAATATGCGGTG
HIR_COI ATGTGTTGATATAGCTACCCCCATCACATATATAGCTGGTGCATCTTCTATTTCAGGATCTTCCAATTTCATTCACTATGTTATCAATATACGAAC
LUMBRICU ATCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCCCTTCATTTAGCAGGTGCGTCATCTATTCTAGGGGCTATTAATTTTATTACCACTGTAATCAACATACGCTG
MOBS ATCTGTGGACCTAGCCATCTTTTCCTTACATCTAGCTGGAGCTTCATCCATTTTAGGCTCTTTAAACTTTATAACTACTGTATTAAATATACGTTG
OEMA_COI TTCAGTTGATTTAGCAATTTTTTCTCTTCATTTAGCAGGTGCTAGATCTATTTTAGGGGCTTTAAATTTTATGACTACAGTAATGAATATACGATG
PGEO_co1 TTCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCATTACATCTAGCTGGTATTTCATCTATTTTAGGAGCATTAAATTTTATTACAACAGTAATTAATATGCGTTG
PTAN_COI ATCTGTTGATTTAGCTATTTTTTCTCTCCATTTAGCAGGGGCTAGATCAATTCTAGGTGCATTAAACTTTATAACCACAGTTATAAATATACGATG
SAAT_COI TTCTGTAGACCTTGCTATTTTCTCAATTCATTTAGCTGGAGCTTCTTCAATTTTAGGTGCTTTAAACTTTATAACCACAGTAATAAATATACGATG
TRMA_COI ATCAGT?GATTTAGCAATTTTTTCTTTACATTTAGCAGGAGCTTCTTCAATTTTAGGAGCCTTAAA?TTTATCACTACTGTTATAAATATACGATG
Tubifex CTCAGTAGACTTAGCAATCTTCTCACTACACTTAGCTGGTGTAGCCTCAATTCTAGGTGCCATTAACTTCATCACTACAATAATTAATATACGTTG
XIFO2_co ATCTGTGGACCTAGCCATCTTTTACTTACATCTAGCTGGAGCTTCATCCATTTTAGGCTCTTTAAACTTTATAACTACTGTATTAAATATACGTTG
XIVI_COI CTCTGTCGACCTTGCTATTTTCTCAATTCATTTAGCCGGAGCTTCTTCAATTCTAGGGGCTTTAAATTTTATGACAACTGTAATAAATATACGATG
[ 490 500 510 520 530 540 550 560 570
| | | | | | | | |
Contig# A?TAGG?ATA?CATTAGATAAAAT?CCHTTATTTGTATGAGCAACATTTATTACAGTAATTATACTATTACTATC?TTACCTGTATTAGCHGGAG?]
ACA_COI ATTAGGCAGAAAGTCAGACCAAATGCCCATATTCGTCTGATCA-TCGTAATCA-AGCAGTACCACTTTACCTATCTCTCCC?GTCCTAGCTGCTG
ANLE ATTAAGAATATCATTAGATAGAATTCCATTATTTGTATGAGCAGCATTTATTACTGTtatTaTattatTATTaTCCttAcCaGTattAgCaGgaG
BDIL_COI ATCAGGAATAACTTTAGATAAGACTCCATTATTTGTTTGAGCAACCTTTATTACTGTAATTATATTACTATTATCCTTACCAGTATTTGCTGGTG
BRPA_COI ACTAGGAATATCCCTTGATAAAATCCCTTTATTCGTATGAGCAACTTTTATTACTGTCATTATACTTCTATTATCCTTACCTGTTCTTGCTGGAG
BRPE AATGGGTATATCTtTAGATAAAATCCCTTTATTCGTCTGAGCAACATTTATTACTGTAATTATATTACTATTGTCCTTACCTGTACTAGCAGGAG
CAGR_COI ACTGGGAATATCTTTAGATAAAATCCCATTATTTGTATGAGCAACATTTATTACAGTTATTATATTGCTACTTTCACTACCTGTACTAGCAGGAG
caho ACTAGGAATATCCTTAGATAAAATCCCTTTATTTGTATGGGCAACATTTATCACTGtAATTATACTTCTGCTATCTCTGCCTGTATTAGCCGGAG
CAME_COI AATTGGGATATCTTTAGATAAAATTCCTTTATTTGTATGAGCTACATT?ATTACAGTAATTATACTTCTTCTTTCATTACCTGTATTAGCAGGAG
CAMO_COI AATTGGTATATCTTTAGATAAAATTCCATTATTCGTATGAGCTACATTTATTACAGTAATTATACTATTACTATCATTACCTGTACTAGCAGGAG
CAPA_COI ATTAGGTATATCTCTTGATAAAATTCCATTATTTGTATGAGGTACATTTATTACAGTAATTATATTATTATTATCATTACCTGTATTTGCTGGTG
CAPH_COI ACTAGGAATATCCTTAGATAAAATCCCTTTATTTGTATGGGCAACATTTATCACTGTAATTATACTTCTGCTATCTCTGCCTGTATTAGCCGGAG
CEPR ACAAGGTATaaCATTAGATCGtttACCTTTATTTATTTGaGCTGTaTTTATTACAGTTATTaTACTAcTAtTATCAtTACCTGTATTAGCAGgaG
CISA_lcO ACTAGGTATAACATTAGACGAAAT?CCTTTATTTGTATGGGCTGCATTTAGTACAGTTATTCTACTACTATTATCATTACCTGTATTAGCAGGAG
CROG_COI GTTAGGAATATCTCTTGATAAAATCCCCTTATTTGTATGAGCAACCTTTATTACAGTAATTATATTATTATTGTCCTTACCTGTTTTTGCTGGTG
EOC_COI AAAAGGTATATCATTAGATCGAGTGCCTTTATTTATTTGATCAGTAGTTATTACCACAGTACTACTATTATTATCCTTACCAGTTTTAGCAGCTG
GC2_co1 ACAAGGAATAACATTAGAACGAATACCTTTATTTATTTGAGCTGTATTTATTACAGTTATTTTATTATTATTATCATTACCTGTATTAGCCGCTG
HIR_COI TAAGGGTATAGGAAATGAACGAGTTCCATTATTCGTTTGATCTGTAGTAATTACTACTATTTCATTATTACTTTCGTTACCGGTGTTAGCAGCAG
LUMBRICU AAGTGGGTTACGACTAGAACGAATCCCTCTGTTTGTCTGAGCTGTATTAATTACAGTAGTTCTCCTCCTCCTATCCCTTCCTGTACTTGCCGGAG
MOBS ACAAGGTATACAAATTGA?CGTCTTCCATTATTCGTTTGAGCAGTATTTATCACAGTAATTTTACTATTACCTTCCCTCCCAGTTTTAGCTGCTG
OEMA_COI AATTGGAATATCTTTAGATAAAATTCCTTTATTTGTATGAGCTACATTTATTACAGTAATTATACTATTACTATCTCTTCCAGTATTAGCAGGAG
PGEO_co1 AGAGGGTATAAAATTAGAACGTTTACCACTATTTGTATGATCAGTTTTAATTACTGTTGTATTATTATTATTATCTTTGCCTGTATTAGCAGCAG
PTAN_COI AATTGGCATATCATTAGATAAAATCCCTTTATTTGTATGGGCCACATTTATTACTGTAATTATACTACTTTTATCGCTGCCAGTGCTAGCTGGAG
SAAT_COI GAATGGAATAACATTAGATAAAATTCCTTTATTCGTATGAGCTACCTTTATTACAGTAATTATACTTCTTCTTTCTTTACCTGTATTAGCTGGTG
TRMA_COI ATTAGGTATAACATTAGATC??GTACCATTATTCGTATGAGCA?CTTTTATTACAGTAATCATACTTTTACTATCTTTACCAGTATTTGCAGGAG
Tubifex AAAAGGTATACGCCTAGAACGAATCCCATTATTTGTTTGATCAGTAATTATTACTGTAATTCTTTTACTACTTACACTTCCAGTACTAGCCGGTG
XIFO2_co ACAAGGTATACAAATTGAACGTCTCCCATTATTCGTTTGAGCAGTATTTATTACAGTAATTTTACTATTACTTTCCCTCCCAGTTTTAGCTGCTG
XIVI_COI AAGGGGAATAACATTAGACAAAATTCCTTTATTTGTATGAGCTACCTTTATTACAGTAATTATACTTCTTCTTTCTTTACCTGTATTAGCTGGTG
[ 580 590 600 610 620 630 640 650 660
| | | | | | | | |
Contig# CTATTACHATACTATTAACHGATCGAAATTTTAATACTTCATTTTTTGA?CCTGC?GGAGGDGGAGACCCHATTTTATTHCAA]
ACA_COI GCATCACTATACTATTGACAGACTGCAACTTCAACACCACCTTCTTCGACCCCGCCGGAGGAGGAGACCCCATTCTATATCAA
ANLE CaaTTaCTATaCTTCtTaCAGATCGaaaTTTTAaTACTTCATTCTTTGATCCTGCTGGTGtaGgaGatcctATTCTcTTTCAA
BDIL_COI AATTTACTATATTGTT-ACTGATCGCAATTTTAATACTTCATTTTTTGATCCTGCAGGAGGTGGGGATCATATTCTATTCCAA
BRPA_COI CAATTACTATACTTCTTACTGATCGAAATTTTAATACTTCCTTCTTTGACCCAGCTGGTGGTGGAGACCCTATTTTATTTCAG
BRPE CCATCACTATACTACTAACTGATCGTAATTTTAACACCTCATTTTTTGATCCTGCAGGAGGAGGAGATCCTATTTTATTCCAA
CAGR_COI CCATTACAATGCTGTTAACAGACCGAAATTTTAATACCTCATTTTTTGACCCCGCAGGGGGAGGGGACCCTATTTTATTCCAG
caho CAATTACAATACTTCTAACTGACCGAAATTTTAACACCTCATTTTTTGATCCTGCTGGAgGTGGAGACCCTATTTTATTTCAA
CAME_COI CTATTACAATACTGTTAACCGATCGAAACTTTAATACGTCCTTTTTTGACCCAGCAGGAGGTGGAGACCCAATTCTATTACAA
CAMO_COI CCATCACAATACTTCTAACTGACCGCAATTTTAATACTTCTTTTTTTGATCCAGCAGGGGGTGGAGACCCAATTTTATTCCAA
CAPA_COI CAATCACAATATTATTAACAGATCGAAACTTTAATACTTCTTTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTCTATTTCAA
CAPH_COI CAATTACAATACTTCTAACTGACCGAAATTTTAACACCTCATTTTTTGATCCTGCTGGAGGTGGAGACCCTATTTTATTTCAA
CEPR CtATTACTATATTATTAACtGATCGAAAtTTTAAtACATCTTTcTTTGAcCCTAcAGGGGGTGGAGAcCCt?GTTCTaTt???
CISA_lcO CAATTACAATACTATTAACTGACCGAAATTTTAACACTTCTTTTTTTGATCCTGCTGGAGGTGGATGATCCAGTTCTATACAA
CROG_COI CTATTACAATACTATTAACTGACCGAAATTTTAATACCTCTTTTTTTGATCCTGCTGGAGGAGGAGATCCTATTCTTTTTCAA
EOC_COI CTATTACTATATTACTAACTGACCGAAATTTAAATACTTCTTTCTTTGACCCTGCAGGAGGAGGAGACCCTATTTTATTCCAA
GC2_co1 CTATTACCATATTATTAACAGATCGAAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCTATAGGAGGGGGTGATCCAGTACTATATCAA
HIR_COI CTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTGAATACTTCATTCTTTGATCCTATAGGTGGTGGAGATCCAGTATTATTTCAG
LUMBRICU CAATCACAATACTCCTAACAGATCGAAATCTTAATACCTCATTTTTCGA??????????????????????????????????
MOBS CTATTACAATGCTTCTT??????????????????????????????????????????????????????????????????
OEMA_COI CTATTACTATACTTTTAACAGACCGAAACTTCAATACCTCATTTTTTGATCCAGCCGGGGGAGGTGATCCAATCTTATTCCAA
PGEO_co1 CTATTACTATATTACTTACTGATCGTAATTTAAATACAACATTTTTTGATCCAGTTGGTGGGGGAGACCCAATTTTATATCAA
PTAN_COI CTATTACTATACTTTTAACAGATCGCAATTTTAACACATCTTTTTTTGACCCTGCTGGGGGTGGAGACCCTATCTTATTCCAA
SAAT_COI CTATTACTATATTACTGACAGATCGAAATTTTAACACTTCATTTTTTGACCCTGCTGGAGGAGGAGACCCTATTCTTTTCCAA
TRMA_COI CAATTACTATATTATTAACAGACCGAAATTTTAATACTTCATTCTTTGACCCAGCAGGAGGTGGAGACCCAGTTTTATTACAA
Tubifex CAATTACCATACTACTAACAGACCGAAATCTAAATACTTCATTCTTCGACCCTGCCGGTGGGGGAGACCCTGTTCTTTATCAA
XIFO2_co CTATTACTATACTTCTTACTGATCGTAATTTAAATACTACTTTCTTCGACCCTATGGGTGGTGGGGACCCAGTATTATATCAA
XIVI_COI CTATTACCATATTATTAACAGATCGAAATTTTAATACTTCATTTTTTGATCCTGCTGGAGGAGGTGACCCTATTCTTTTCCAA
[24 morphological]
ACA_C8S A???? ????? ????? ???? ?AACC
ANLE CAACG CAACA AAAAA CCAA CCCCC
BDIL_C8S ACACG AAAAC AACAA A?AA CCCCC
BRPA_C8S AACCG AAAAC CAAAA CCAA CCCCC
BRPE_C8S AACCG AAAAC CAAAA CCAA CCCCC
CAGR_C8s ACAAG AGGAA AAAAA CCAA CCCCC
CAHO_C8s ACAAG AGGAA AAAAA CCAA CCCCC
CAME_C8S ACAAG AGGAA AAAAA CCAA CCCCC
CAMO_C8S ACAAG AGGAA AAAAA CCAA CCCCC
CAPA_C8s ACAAG AGGAA AAAAA CCAA CCCCC
CAPH_C8s ACAAG AGGAA AAAAA CCAA CCCCC
CEPR ACAAG accac AcAAA C?cA CCCCC
CISA_C8s AAAGG AAAAC AAAAA CCCA CCCCC
CROG_C8s ACACG AAAAC AAAAA C?AA CCCCC
EOC_C8S AA??? ????? ????? ???C ?CACC
GCG_C8S GA??? ????? ????? ???C ?CACC
HIR_C8S AA??? ????? ????? ???C ?CCCC
Lumb_rubC8s AAAAC ????? ????? ???? ?AAAA
MOBS acaag aaaac acaaa c?aa ccccc
OEMA_C8s ACAAG AGCAC ACAAA C?AA CCCCC
PGEO_C8S AA??? ????? ????? ???C ?CACC
PTAN_C8S ACAAG AGCAA AAAAA C?CA CCCCC
SAAT_C8S ACAAG AGGA? AAAAA C?AA CCCCC
TRMA_C8s ACAAC AAACC AAAAA C?AC CCCCC
Tubifex_C8s AAAAA ????? ????? ???? ?AAAA
XIFO CAAAG AAACA AAAAA C?AA CCCCC
XIVI_C8s GAAGG AAAAA ACAAC CCAA CCCCC
;
end;
begin assumptions;
charset 18S = 1-1827;
charset COI = 1828-2456;
charset morph = 2457-2478;
end;